Каждый студент докторской программы обучения имеет право на смену предмета из своего учебного плана на любой другой по своему выбору. Предмет может быть изменен до конца периода сессии, в летнем семестре это 30 июня. Этот вопрос не требует больших усилий. Все, что требуется для этого, это заполнение нескольких документов.

Во-первых, необходимо определиться с предметом, на который будет произведена замена. Нужно учесть некоторые тонкости. Например, стоит обратить внимание на семестр проподавания предмета, указанный на странице предмета. Например, предмет может преподаваться только в летнем семестре. Тогда записаться на него будет можно только в следующем году в летнем семестре. Поскольку на втором курсе в летнем семестре организуются госэкзамены для докторантов, то включение предмета в учебный план на второй курс может привести к сдвигу сдачи госэкзамена на один год.
Во-вторых, нужно заполнить два документа. Это дополнение к учебному плану (Dodatek individualního studijního plánu) и заявление (Žádost). В дополнении к учебному плану указываются следующие пункты:

• «vyměna <код старого предмета> za <код нового предмета>»
• «přenos SDZ na rok год/год (в случае сдвига гос экзамена на год)»

Документ выглядит так:

Žádost необходимо обязательно заполнить для смены предмета. В поле věc пишется: «žádám o výměnu <код предмета> (zimní (letní) semestr <год>) za <код предмета> (zimní (letní) semestr <год>)». В поле odůvodnění нужно указать причину (например, что предмет в большей степени соответствует теме проекта).
Вот пример моего заявления:

В случае необходимости сдвига гос экзамена нужно заполнить еще один экзампляр “жадости” для переноса SDZ. Здесь в поле věc пишется: «žádám o přenos SDZ na rok <год>/<год>». Odůvodnění будет: «kvůli změně předmetu».

С этими документами нужно подойти к своему руководителю за подписью и отнести в деканат. Остальное уже сделает деканат. Изменение в учебный план будет внесено уже в течение следующей недели.
Все просто! Не стесняйтесь пользоваться возможностями, которые вам предоставляет европейская система образования.